《星際少年隊》的故事背景設(shè)定在一個近未來的反烏托邦世界。第三次世界大戰(zhàn)徹底摧毀了舊有的國家體系，世界被各大企業(yè)集團(tuán)所瓜分和統(tǒng)治。在這個混亂的時代，一種被稱為“E'S”的特殊人類開始出現(xiàn)。他們擁有將精神力轉(zhuǎn)化為物理力量的超能力，但這種能力也使他們被普通民眾視為怪物，遭受著普遍的恐懼、歧視與迫害。 主角戒·玖堂是一名年輕的E'S能力者，他隸屬于一個名為“阿修羅姆”的企業(yè)所屬精英能力者部隊。在一次針對廢棄巨型人工都市“加爾都”中游擊隊的鎮(zhèn)壓行動中，戒遭到了同為阿修羅姆成員、且對他抱有強(qiáng)烈競爭與厭惡情緒的少年神龍的偷襲而身受重傷。瀕死之際，他被居住在加爾都的善良少女明日香·篤川發(fā)現(xiàn)并救下。 在加爾都養(yǎng)傷期間，戒感受到了與冰冷殘酷的阿修羅姆截然不同的、人與人之間的溫情。當(dāng)他傷勢痊愈，準(zhǔn)備返回部隊時，卻意外目睹了阿修羅姆派遣的殺戮機(jī)器“耶格爾”對無辜平民進(jìn)行的大屠殺。這殘酷的一幕徹底動搖了戒對組織的忠誠與信念。他無法認(rèn)同這種暴行，毅然拒絕了歸隊的命令，并擊退了前來追殺他的耶格爾。最終，戒決定脫離阿修羅姆，留在加爾都。 故事由此展開，戒與明日香以及加爾都的其他居民們共同生活，并逐漸卷入了與阿修羅姆及其他勢力的沖突之中。他不僅要面對來自原組織的追捕和昔日戰(zhàn)友的敵意，還要在這個充滿偏見與戰(zhàn)火的世界里，重新尋找自己的身份、立場以及想要守護(hù)的事物。作品通過戒的視角，探討了戰(zhàn)爭、人性、歧視與自我救贖等深刻主題，描繪了一群少年在末世背景下掙扎、戰(zhàn)斗與成長的波瀾壯闊的物語。