《名偵探柯南:引爆摩天樓》是《名偵探柯南》系列的首部劇場版。故事始于知名建筑設計師森谷帝二舉辦的一場茶會,他邀請工藤新一出席,但已變小的新一只能拜托小蘭代為參加。小蘭與柯南、毛利小五郎一同前往,立刻被森谷府邸極致對稱的建筑美學所震撼。茶會上,森谷帝二公然抨擊現(xiàn)代年輕設計師破壞了建筑的美學準則??履铣晒ζ平饬怂o賓客出的謎題,得以與小蘭參觀其設計展覽館。交談中,森谷帝二流露出對早期不完美作品的深深遺憾,并從小蘭口中套出了她將與新一在米花大樓慶祝生日的計劃。
不久后,自稱“新一的挑戰(zhàn)者”的神秘人開始接連打電話給柯南,預告在特定地點安置了炸彈??履蠎{借智慧與勇氣,在警方協(xié)助下逐一化解危機。通過分析爆炸案,柯南發(fā)現(xiàn)所有目標建筑附近,都有一棟森谷帝二自認為“不完美”(即非絕對對稱)的早期作品。這一發(fā)現(xiàn)讓他驚覺幕后黑手很可能就是森谷帝二本人。
柯南與毛利小五郎及警方前往森谷宅邸調(diào)查,柯南暗中搜尋,最終找到了證明森谷帝二就是真兇的決定性證據(jù)。原來,森谷帝二是一個極端的完美主義者,無法容忍自己因妥協(xié)而設計出的非對稱作品,決心親手將它們?nèi)空?。同時,他也將對工藤新一的怨恨融入計劃——因為新一(以工藤新一身份破案時)曾間接導致他宏偉的西多摩市新城規(guī)劃案被否決。就在森谷帝二被捕的瞬間,他陰冷的笑容讓柯南猛然醒悟:即將舉行生日約會的米花大樓,正是森谷帝二另一件“不完美”的作品,而小蘭此刻正在那里等待。電影在柯南爭分奪秒奔向米花大樓的緊張高潮中,將懸念與情感推向極致。