在《名偵探柯南：迷宮的十字路口》中，東京、大阪和京都三地相繼發(fā)生了一系列恐怖的殺人事件。五名受害者均被一個頭戴面具的神秘人以武士刀和弓箭瞬間殺害。警方調查發(fā)現(xiàn)，所有死者都屬于一個名為“源氏螢”的盜竊集團，該集團專門偷竊著名的佛像和藝術品。集團共有八名成員，他們都以日本歷史人物義經的家臣名字互稱，并且每人持有一本《義經記》。令人不解的是，每位遇害者手中的《義經記》都被兇手拿走了。 與此同時，京都的古剎山能寺收到了一封神秘來信，聲稱只要解開隨信附上的畫謎，就能找到八年前寺內失竊的珍貴如來佛像。毛利小五郎帶著女兒小蘭和柯南來到寺廟，但面對復雜的畫謎，眾人一籌莫展。另一方面，大阪的高中生偵探服部平次也因與其中一名受害者有舊而來到京都，他一方面秘密調查案件，另一方面也想借此機會尋找自己童年時的初戀情人。 柯南與服部平次在京都偶然相遇，兩位天才偵探決定聯(lián)手追查真相。然而，在調查過程中，他們發(fā)現(xiàn)有人意圖殺害服部平次。緊接著，“源氏螢”的另一名成員也慘遭毒手。所有的線索似乎都指向那封神秘的信和畫謎?？履吓c服部必須在古都京都的街道與寺廟間穿梭，解開交織著歷史傳說、盜竊陰謀與個人恩怨的迷局，趕在兇手再次行動前，揭開“源氏螢”背后的秘密與畫謎的真正含義，并保護身邊的人免受傷害。