《肝膽昆侖》講述了董斐（陳鍵鋒飾）與姐姐董嵐（蓋鳴暉飾）姐弟二人的命運糾葛與江湖歷險。董斐不顧亡父遺訓，偷偷離開自幼居住的桃花村，途中與性格直率的漁家子常歡（吳卓羲飾）結為好友。二人同往錢塘江觀潮時，董斐對氣質出眾的富家千金邢曉雪（曹敏莉飾）一見傾心，埋下了情感的種子。
姐弟二人意外發(fā)現(xiàn)父親當年并非自然死亡，而是含冤而逝。為替父昭雪，他們決定在杭州落腳，暗中展開調查。董嵐在查案過程中，結識了偽裝成搭棚工人的節(jié)衡都尉狄英偉（元華飾）。狄英偉身負義兄被滄洲五鬼所殺的血仇，為方便追查真兇，一直隱匿身份。隨著線索逐漸浮現(xiàn)，一個驚人的真相被揭開：董父之死，竟與兇名在外的滄洲五鬼以及邢曉雪的父親有著千絲萬縷的關聯(lián)，各方勢力環(huán)環(huán)相扣。
另一方面，董斐與好兄弟常歡因同時愛慕邢曉雪而產生嫌隙，友情面臨考驗。更令人痛心的是，在追查真相與欲望的漩渦中，董斐逐漸迷失，竟被利欲蒙蔽心智，做出了傷害至親姐姐董嵐的舉動。故事在撲朔迷離的案情、復雜糾葛的情感與驚心動魄的江湖恩怨中推進，描繪了人物在情義與欲望、復仇與寬恕之間的艱難抉擇，上演了一幕幕扣人心弦的肝膽傳奇。
