《火魅子傳》的故事始于耶麻臺國莊嚴而熱鬧的女皇選舉盛典。然而,喜慶之下暗流涌動,鄰國狗根國在紫香樂的指揮下,利用浮游要塞發(fā)動了蓄謀已久的突然襲擊,瞬間將耶麻臺國化為火海。紫香樂的目標是地下神殿中蘊藏著強大力量、足以征服世界的“墨火”。在混亂中,女皇候選人們被墨火的保護力量傳送至安全處,而在地下神殿內(nèi),為了保護還是嬰兒的女兒日魅子,火魅子的母親一與慘遭紫香樂毒手。危急關頭,火魅子被投入火焰,卻奇跡般地被光芒籠罩,在祭司的咒語中消失無蹤,隨后神殿涌出了神秘的“暗之泉”。
鏡頭轉(zhuǎn)向現(xiàn)代日本,少年九峪在清晨上學路上遇到了神秘的轉(zhuǎn)校生日魅子,她的一個玩笑讓九峪印象深刻。在考古挖掘場的閑談中,九峪不禁回想起與日魅子初次相遇的情景。當天下午,他在兩人初遇的石階上找到了沉思的日魅子。就在他們交談時,日魅子周身突然迸發(fā)出耀眼的光芒,這與九峪記憶中某個模糊的場景驚人地相似。沒有絲毫猶豫,九峪奮不顧身地沖進光中,隨后兩人一同從現(xiàn)代世界消失了。
故事由此雙線并行:一方面,幸存的女皇候選人們肩負起各自使命,踏上拯救耶麻臺國的征程;另一方面,穿越到異世界的九峪和日魅子,發(fā)現(xiàn)自己卷入了耶麻臺國與狗根國爭奪墨火的宏大戰(zhàn)爭之中?;瘅茸拥拿\、墨火的秘密、暗之泉的真相,以及兩位穿越少年少女在這個奇幻世界所扮演的關鍵角色,共同編織出一部集冒險、戰(zhàn)斗、奇幻與命運于一體的壯闊物語。